李根勤前去和杨志峰带来的文物走私犯见面，却突然接到杨吉娜从自己的别墅里逃跑了的消息。
杨吉娜从别墅逃出，却没有躲过程华预先埋伏下的监控小组。两个警察跟踪杨吉娜到一家宾馆，准备伺机抓捕和她联系的人。
程华得知杨吉娜和李成和几乎同时出逃，感觉不妙，和大刘一起赶到杨吉娜入住的宾馆，等程华进入杨吉娜的房间，才发现杨吉娜假装妓女，偷走一个嫖客的衣服，女扮男装从警方的视线里消失。
李成和偷偷联络杨志峰，告诉他自己准备和杨吉娜一起出逃。杨志峰却想让他留下来，一起干完偷盗博物馆文物的事情再说。李成和无奈让杨志峰联络丁三，拿了一笔钱之后消失。
杨志峰找到丁三，拉他和自己一起去见那个张姓文物走私贩子。狡猾的丁三事先让王强做好了跟踪张姓文物贩子的准备。
丁三当面拒绝了杨志峰和文物贩子拉他入伙的事情，可是等甩开杨志峰以后，又独自去见了此人，和此人进行了一番密谋，并从此人手里买了两只手枪。
大刘和程华开始细致调查杨吉娜的背景。得知丁三在几年之前也曾追求过杨吉娜，程华错误地把丁三和李成和当成了情敌关系，再次放松了对丁三的警惕。
真凶难逃第12集剧情介绍李成和发现了杨吉娜身上被李根勤毒打以后留下的伤痕，改变主意，决定要在逃跑之前先杀掉李根勤。
程华想到了李成和可能要报复李根勤，安排大刘去李根勤所住的别墅附近进行监控，谁知道却被李根勤发现。
李成和找到丁三，让他帮忙和他一起去刺杀李根勤。诡计多端的丁三为了让李成和赶紧把警方的视线吸引走，答应了李成和的要求，把从曹鹏手里抢来的那把警枪给了他。
李根勤觉得自己被警方监控不自由，设法甩开了监控他的大刘等人，那想到他刚一出警方的视线，就被人在路上狙击，挨了两颗子弹……
大刘发现李根勤被刺杀，紧急朝凶手逃走的方向，追了过去……
李根勤被枪击负重伤，大刘一路追捕无果，只在凶手逃走的路上发现一块嚼过的口香糖。齐峰在李根勤被枪击的现场，发现了李成和同伙的足迹。
王强用偷来的汽车，接应行刺李根勤的李成和和丁三。丁三和王强送走了李成和和杨吉娜，没人知道他心里却是别样滋味在心头。
丁三让王强把作案用过的汽车烧掉，贪财的王强来到车市偷偷把车卖给了毫不知情、正在看车的赵兽医。结果老赵刚开着车想继续他的“侦探”事业，自己反而被巡逻的特警发现抓了起来。
王强卖掉赃车，去网吧玩游戏散心。在这里再次遇见对他十分崇拜的刘小杰，两人的关系又近一步。
真凶难逃第13集剧情介绍孟津虽然负伤，却继续在网上收集寻找有关“盟主”的情况，要和“盟主”PK一款电脑游戏，试图激怒“盟主”引他现身。谁知道没有引出“盟主”，却发现了一个网名叫“HERO”的网友和“盟主“似乎关系密切。他没想到“HERO”其实就是刘小杰。
刘小杰安排王强和“电脑狂”PK，王强却因为在网上发现重要的事情，再次放弃和电脑狂(孟津)在网上联系。孟津只好另找机会。
负伤躺在医院的李根勤放出风来，要用100万买李成和一条命。
丁三正在为实施下一步作案头疼，王强却给他带来了他从网上得知海港警方已经在地下管道中发现李成国尸体的消息。
此事不仅让丁三和王强心惊肉跳，也勾起了程华对牺牲了的男友曹鹏的思念之情。
丁三感觉警方的大网越收越紧，干脆去单位请假，准备专心筹备作案和逃走。但是他和王强勘查了作案现场以后，却觉得事情远没有他设想的那么简单。
李成和和杨吉娜逃亡，不敢乘坐公共交通，而是一路搭乘过路的车辆。他怎么也没想到自己这个“恶人”，却遇到了更加混蛋的几个车匪，对方把他们打翻绑了起来……
程华和老齐回海港沟通李成和兄弟的两个案件。齐峰破解了程华心里一直存在的曹鹏被杀的心理障碍。
丁三感觉自己准备抢劫医院运钞车的作案计划无法实施，再次约杨志峰，两人试图合伙针对博物馆里的文物下手。
真凶难逃第14集剧情介绍孟津得知“HERO”就是刘小杰，很是纠结。为了早日破案，他去小杰家偷偷在在他的电脑上做了手脚。可是当小杰再次联络王强和孟津PK时，却被狡猾的丁三给阻止了。
李成和和杨吉娜两人被抢，为了安全，李成和把杨吉娜一个人留在城郊出租屋，独自返回滨河市内想办法搞钱。
李成和先找到杨志峰，从他那里获知了自己哥哥尸体被找到的事情，对丁三先前所说的情况产生了怀疑，认为李成国可能死于丁三之手。李成和让王强去找杨吉娜，王强表面答应李成和，其实他根本没去，把这一切告诉了丁三。
就在丁三和杨志峰积极筹备新的犯罪计划之时，那几个抢劫李成和、杨吉娜的犯罪分子因为使用杨吉娜的银行卡取钱，被警方捕获。程华等人通过他们的交代，推测出李成和和杨吉娜可能的藏身地点，布网准备抓捕两人。
不想丁三听了王强的消息，担心夜长梦多，想出一个办法，准备抢先绑架杨吉娜，以此控制李成和，找到李成和从曲家偷出的赃物。
真凶难逃第15集剧情介绍当李成和询问王强当年哥哥被杀的细节时，王强猜到前面的事情可能被李成和识破，急忙找丁三商量对策。丁三给李成和下好了一个看似完美的圈套。丁三找到杨吉娜，把她骗出出租屋，来到农田中，举起了手里的刀子……
程华等人赶到李成和和杨吉娜的藏身地点，听说当地派出所已经控制了两人藏身的地点，十分高兴。但是程华突然发现情况有异常，当大家冲进去时，发现已经人去屋空。
程华调来警犬试图追踪出两人的踪迹，谁知警犬却似乎因为嗅到某种气味止步不前。程华请赵宏光前来帮忙，调整好了警犬的状态，一路追踪到田野当中。警方虽然没有抓捕到李成和和杨吉娜，却发现了杨吉娜被人绑架的线索，并找到了丁三绑架杨吉娜时抛弃到机井里的行李箱。
柯宁听说再次抓捕李成和失败，严厉批评了程华等人。专案组成员承受着巨大的压力。
丁三将杨吉娜囚禁在一个偏僻地方，他让王强想办法让杨吉娜说出李成和藏匿赃物的地点，杨吉娜知道自己说出实情，就会被杀，咬死不说，双方一时之间陷入僵局。
